Вот один из примеров, как можно это реализовать с помощью загрузочного диска FreeDOS.
1. Качаем образ загрзочного CD диска с чистым DOS
2. С помощью программы (можно использовать к примеру UltraISO) редактирования образа закидываем в него исполняемый файл (например afudos.exe - для прошивки материнской платы ASUS), а также файл прошивки. Файлы лучше сохранить в папку FREEDOS, тогда они будут сразу доступны после запуска системы DOS, После добавления файлов в образ сохраняем его.
3. Записываем CD-диск из изменённого образа любой удобной програмой.
4. Используем диск по назначению.